1)住房公積金貸款利率比商業(yè)銀行住房貸款利率低，五年(含五年)以下公積金貸款年利率為3．6％，商業(yè)銀行同期個(gè)人住房貸款利率為4．77％，五年以上住房公積金住房貸款年利率為4．05％，商業(yè)銀行同期個(gè)人住房貸款利率為5．04％。
2)貸款對(duì)象的條件要求不同，公積金貸款對(duì)象需要是北京公積金系統(tǒng)公積金繳存人；商業(yè)住房貸款不需要是公積金繳存人。
3)對(duì)貸款人年齡的限制不同，一般來(lái)講商業(yè)銀行個(gè)人住房貸款有年齡上限，而公積金住房貸款沒有年齡的限制。
4)商業(yè)銀行住房貸款最高可以貸到房屋總價(jià)的80％，根據(jù)所購(gòu)住房性質(zhì)不同，住房公積金貸款可以貸到房屋總價(jià)的90％或95％。
5)貸款的擔(dān)保方式不同，商業(yè)銀行貸款一般是在房產(chǎn)證抵押登記前采用開發(fā)商階段性連帶責(zé)任保證擔(dān)保方式，在抵押登記后采用抵押的擔(dān)保方式。公積金貸款擔(dān)保方式主要是北京市住房貸款擔(dān)保中心所提供的連帶責(zé)任擔(dān)保。
6)所需要費(fèi)用不同，商業(yè)銀行住房貸款一般需要律師費(fèi)用、保險(xiǎn)費(fèi)用，而住房公積金住房貸款一般需要擔(dān)保費(fèi)和評(píng)估費(fèi)。
7)對(duì)單筆貸款最高額度規(guī)定不同，一般來(lái)說(shuō)，商業(yè)銀行住房貸款對(duì)單筆貸款最高額度沒有規(guī)定，而公積金貸款目前最高只能夠貸40萬(wàn)，信用等級(jí)為aa的最高不超過(guò)46萬(wàn)，信用等級(jí)為aaa的最高不超過(guò)52萬(wàn)。
8)北京住房公積金管理中心為住房公積金貸款的借款人，統(tǒng)一向中國(guó)太平洋財(cái)產(chǎn)保險(xiǎn)股份有限公司北京分公司購(gòu)買了個(gè)人抵押商品住房保險(xiǎn)。保險(xiǎn)融合了財(cái)產(chǎn)損失保險(xiǎn)和人身意外傷害保險(xiǎn)兩方面的內(nèi)容，使借款人免費(fèi)享受到保險(xiǎn)。而一般商業(yè)銀行住房貸款，借款人無(wú)法免費(fèi)享受這方面的保險(xiǎn)。
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